Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ms4a4dQ99N05 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ms4a4dQ99N05 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms