Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms