Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc12a9Q99MR3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc12a9Q99MR3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms