Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms