Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PsphQ99LS3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PsphQ99LS3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms