Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pagr1aQ99L02 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms