Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms