Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lactb2Q99KR3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms