Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reep3Q99KK1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms