Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG5

Lsr, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsrQ99KG5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LsrQ99KG5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LsrQ99KG5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms