Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms