Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms