Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms