Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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