Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csmd1Q923L3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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