Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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