Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msi2Q920Q6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms