Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms