Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpe65Q91ZQ5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms