Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms