Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdha8Q91Y12 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms