Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms