Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usb1Q91W78 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms