Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms