Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms