Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEA8

Rab7b, Ras-related protein Rab-7b, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab7bQ8VEA8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab7bQ8VEA8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab7bQ8VEA8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab7bQ8VEA8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab7bQ8VEA8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab7bQ8VEA8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab7bQ8VEA8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms