Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1aQ8VDS4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1aQ8VDS4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms