Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fyco1Q8VDC1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms