Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc8Q8VD72 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc8Q8VD72 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc8Q8VD72 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc8Q8VD72 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ttc8Q8VD72 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ttc8Q8VD72 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ttc8Q8VD72 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Ttc8Q8VD72 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc8Q8VD72 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Ttc8Q8VD72 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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