Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SgtbQ8VD33 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms