Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MpdzQ8VBX6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MpdzQ8VBX6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms