Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc58Q8R3Q6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc58Q8R3Q6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc58Q8R3Q6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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