Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmpQ8R373 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmpQ8R373 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmpQ8R373 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmpQ8R373 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmpQ8R373 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmpQ8R373 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmpQ8R373 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms