Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms