Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CipcQ8R0W1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms