Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf183Q8QZS5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf183Q8QZS5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf183Q8QZS5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf183Q8QZS5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf183Q8QZS5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf183Q8QZS5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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