Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpv3Q8K424 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms