Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms