Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scara5Q8K299 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms