Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abcf3Q8K268 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Abcf3Q8K268 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcf3Q8K268 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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