Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr1eQ8K202 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms