Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms