Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgbQ8K0E8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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FgbQ8K0E8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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FgbQ8K0E8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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FgbQ8K0E8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FgbQ8K0E8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FgbQ8K0E8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgbQ8K0E8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms