Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma3Q8JZW8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms