Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms