Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms