Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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Card11Q8CIS0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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Card11Q8CIS0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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Card11Q8CIS0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Card11Q8CIS0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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Card11Q8CIS0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Card11Q8CIS0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Card11Q8CIS0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Card11Q8CIS0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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Card11Q8CIS0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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Card11Q8CIS0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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Card11Q8CIS0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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Card11Q8CIS0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Card11Q8CIS0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms