Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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