Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG79

Tp53bp2, Apoptosis-stimulating of p53 protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp2Q8CG79 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tp53bp2Q8CG79 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp2Q8CG79 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp2Q8CG79 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp2Q8CG79 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp2Q8CG79 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp2Q8CG79 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp2Q8CG79 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp2Q8CG79 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53bp2Q8CG79 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms