Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms